1964年，在丽江城南11公里处的木家桥，发现一个人类头骨化石，经鉴定研究，属距今10万一5万年的智人阶段化石，定名为“丽江人”，为一少年女性。

　 其后，又在该地点陆续发现旧石器时代的石器28件，有石核、石片、刮削器、砍研器、名球等，并发现一件鹿角工具。

　　1980年以来，在距丽江城数十公里的大东热水塘。九河等地，先后发现新石器时代的遗物，包括石斧、石键、石凿、骨针等。

　 自60年代末迄今，在距丽江城4公里的马鞍山、离城百里之内的金沙江沿岸大具、石鼓、红岩等地，陆续发现青铜时代的石棺葬墓群，出土器物有铜器中的矛、剑、缴、刀、镜，以及陶器、海贝等。

　 90年代，又在虎跳峡、宝山花英、鸣音江凹。洪门等金沙江沿岸耳余公里内，发现十多处古崖画，多为牲畜、动物形象，且大多为洞穴崖画，总面积达540平方米，距今有4000年左右。

　　丽江境包括丽江城的主体居住民族是纳西族，那么，纳西族在丽江的居住上限可追溯到何时呢？从族源的考察，有三说：

　　一是土著说：主要基于上述考古发现，认为丽江纳西族是土著民族。按此说，纳西族在丽江的生成、生息时间最古、最长。

　　二是南迁说：据史学家方国瑜等研究认为，丽江纳西族源自古代从西北打湿地区南迁的芜人，秦汉时迁至大渡河、雅碧江流域，即今四〕l盐源、木里、盐边一带，再西迁至今宁获永宁、中甸白地。丽江奉科、大具，再西迁人丽江坝。秦汉时称为席牛夷、白狼夷，晋常球《华阳国志》称摩沙（读suo）夷，隋唐时称磨些（读suo0）蛮。据唐樊绰《蛮书》记载，其时丽江县境金沙江沿岸多是磨些部落，因而把金沙江称为“磨些江”。

　　三是融和说：即丽江纳西族由上著者和南迁者融和而成。此说已被多数学者认同。按此说，古纳西民族的分布中心，在汉唐时逐步完成了从演川交界的东部向西部丽江的大转移。

　　据纳西东巴古籍《创世纪》及《木氏宦谱》记载，纳西族的开山祖名崇忍利恩，其前尚有9代，即海时海忍一海忍拉忍一拉忍美忍一美忍楚此一楚此楚余一楚余初居一初居民生一居生精壬一精壬崇忍，但到崇忍利恩一代，才有创世业绩。崇忍利恩生三子，名思亨糯、糯蓓丕、蓓丕俄。蓓丕俄生俄高勒，俄高勒生高勒趣，高勒趣生四子：梅、禾。束、尤，分别成为纳西族最早的四大支系。梅氏族、禾氏族居金沙江沿岸，束氏族、尤（叶）氏族居丽江坝区。居住丽江城的纳西族主要是束、尤（叶）两支系的后裔。

　　汉武帝元鼎六年（前M）置越高郡，共辖15县，其中丽江为遂久县，至蜀汉时改属云南郡，但县名直至东晋未变。

　　东汉明帝时，出现献诗《白狼王歌》三章，民族语和汉译文并立，《乾隆丽江府志略·艺文略》将它全文记载，并加序注说：“汉永平中，益州刺史梁国朱激，好立功名，慷慨有大略，宣示汉德，威怀远夷，白狼王府鼓等，慕化归义，作乐诗三章，诣精请献于朝，翻遣从事史李陵与键为郡椽田恭上之。帝嘉悦，事下史官录其歌焉。按：白狼即丽江也。”

　　汉晋时期，丽江纳西族基本处于如《史记·西南夷列传》所述“编发随畜迁徙，毋长处，毋君长”的状态，游牧、渔猎、刀耕火种是主要生产方式，东巴经典《十二种畜禽的来历》、《高勒趣招魂》、《献冥马》、《祭牧都、《崇般图》等经书中，都有比较具体的高原游牧生活的描绘，且已描述出牧主与牧奴的阶级分化。这时候，不大可能有相对固定的城地。

　　丽江县金沙江边的奉科，出土过农具“蜀郡”铁锄，铁锄正面呈梯形，“形如履之前半”。由此看，汉晋时期的丽江，首先是金沙江河谷地区，开始进人农耕时代。东巴经《收种庄稼》等经卷中，亦有农耕生产的完整描述，作物除养、青棵、麻等外，还有稻谷生产的记载。农耕生产相对固定，须有一定的管理组织，中央王朝设置了遂久县八后汉书》卷五中亦有“元初四年十二月，越烧夷寇遂久，杀县令”的记载，可以推断，当时的丽江已有县府一类的治所。

　　三国时期，云南在蜀汉治理之下，丽江改属云南郡，县名仍称遂久。在丽江纳西族传说中，诸葛亮“五月渡沪”的地点就在长江第一湾，渡江后诸葛亮立了一面无字的石鼓为碑，以后便有了“石鼓”这个地名。石鼓附近至今还有诸葛营、点将台等地名。还传说诸葛亮教会纳西人种稻谷，纳西人不知道种稻成功之后怎么向他报信，诸葛亮便教纳西人在稻谷抽穗扬花时放孔明灯，这样他在千里之外就会看到，等等。据史家研究，“五月渡沪”南征主要在今曲靖地区，诸葛亮并未到过丽江，但这些传说反映蜀汉时期的民族政策对丽江纳西族的发展确实产生过积极的推动。

　　东晋之后的宋（刘）、齐、梁（420－556年）时期，丽江改为遂段县，隶属于宁州云南郡。

　　自北周至隋（557－617），丽江属南宁州总管督府治下。

　　两晋南北朝时，云南望氏称雄，西吴兴起，宁1州由器氏以刺史名义统治，王朝经营云南可以说是心有余而力不足。至隋初，隋文帝杨坚为了改变缥氏割剧局面，派韦冲为南宁州总管，梁毗为西宁州刺史，并于公元597年、598年先后派太平公史万岁和杨武率军进讨云南，讨平西级首领鬓震和缓玩的武装势力，把云南重新置于中央王朝的直接统治之下。

　 据一些史书零星记载，史万岁进村云南时，也涉及到7丽江。《元一统志》载，丽江县塔城金沙江上的著名铁桥，系隋史万岁、苏荣所建。此桥为铁链桥，所跨之处，“皆穴石熔铁为之’。遂成为长江第一桥，其后吐蓄在此设神川都督，南诏大破吐善断铁桥也在这里。据顾祖禹《读史方舆纪要·云南》“石1’条，史万岁经丽江至塔城建桥，途经丽江红岩，当地有石门关，据说广石门为史万岁用兵之道。